经历了常人难以想象的磨难和考验，艾伦·叶卡（三浦春马 饰）与阿明·阿诺德（本乡奏多 饰）以及其他有着不同背景的年轻人终于成为了合格的调查兵团成员。他们奉命进行首度墙外调查，结果却遭遇了可怕巨人的围猎，伤亡惨重。为了拯救好友，艾伦丧身巨人之口，谁知在巨人的腹中，他体内的神秘基因觉醒。