人気アニメシリーズ「空の境界」の原作者?奈須きのこ率いる「TYPE-MOON」が原作を務め,ゲームやTVアニメなどさまざまメディアで展開する「Fate,staynight」の劇場版少年?士郎は街を焼き尽くすほどの大災害で全てを失い,魔術師を名乗る男に引き取られる。それから10年,士郎はふとしたことから「聖杯戦争」と呼ばれる魔術師同士の争いに巻き込まれ,幼い頃に起きた惨劇を繰り返さないために,壮絶な戦いに身を投じることになる。